Face à la crise, les établissements du PNL ont dû s’adapter et innover afin de répondre au mieux aux besoins des patients. L’usage de l’outil numérique a permis de développer de nombreux projets. Parmi les plus révélateurs, nous pouvons citer le recours à la téléconsultation, dont celle par téléphone pour la psychiatrie, qui s'est très fortement développé. Les établissements PNL ont également mis en place des modes d’organisation adaptés à la gestion de la crise en période aigue ou en période de déprogrammation. A titre d’exemple, l’installation systématique de sas d’entrée pour limiter les risques de contamination entre patients, ont également permis de protéger les professionnels des établissements.
Plus globalement, les établissements du privé solidaire ont démontré une capacité et une agilité des organisations et des fonctionnements dès le début de la pandémie. Ils ont, par exemple, mis en place de nouvelles formes d’activités, ouvert des lits de réanimation en un temps record ou déployé massivement la vaccination en interne dans un temps très court.